Васил Казанджиев е роден през 1934 г. в град Русе. От ранна детска възраст започва да свири на китара и на пиано, а едва десетгодишен - да композира. През 1957 г. завършва композиция при проф. Панчо Владигеров и дирижиране при проф. Влади Симеонов в Държавната консерватория в София.
Васил Казанджиев поставя началото на своята професионална кариера през 1957 г. като диригент в Националната опера и балет, към която е част до 1964 г. От 1962 г. до 1978 г. работи като главен диригент на основания от него камерен ансамбъл "Софийски солисти". В периода 1979 г. - 1993 г. е главен диригент на Симфоничния оркестър на БНР.
Автор е на симфонични и камерни произведения: пет симфонии, сонати и инструментални концерти, "Картини от България", "Живите икони", "Апокалипсис", "Илюминации", три струнни квартета, клавирен квинтет, много театрална и филмова музика. Гастролира в Eвропa, САЩ, Канада, Африка, Япония, Южна Корея.
Васил Казанджиев е отличен с редица награди като диригент и композитор: Втора награда “Симфониета” от Шестия световен младежки фестивал в Москва (1957 г.), Първа награда от Международния фестивал на камерните оркестри в Байройт (1966 г.), Първа награда от Международното биенале за съвременна музика в Загреб (1967 г.), награди от Съюза на композиторите, Съюза на филмовите дейци и много други.
Занимава се и с предагогическа дейност - професор е по оперно и симфонично дирижиране в ДМА. През 2005 г. е избран за член-кореспондент на БАН.