Борис Гуджунов е роден през 1941 г. в град Пазарджик. През 1964 г. завършва Школата за естрадни изпълнители при Българското радио, а през 1967 г. се дипломира от ВИТИЗ “Кръстьо Сарафов”.
В началото на своята музикална кариера, Борис Гуджунов изпълнява рокендрол и шлагери. Дебютният му авторски запис е на песента “Търси се една девойка”. Няколко години е солист на оркестър “София”. Участва на конкурси и фестивали в страната и чужбина, от които отнася и множество награди. Сред добилите широка популярност изпълнения на Борис Гуджунов са “Каквато искаш ти бъди” и “Надежда”.
В началото на 90 – те години, заедно с Борислав Грънчаров и Боян Иванов създават триото “Бо Бо Бо”, с които записват и албума “Момчета с късмет”.
През 1998 г. Борис Гуджунов получава приза на “Златният орфей”за Цялостно творчество, а през 2003 г. събира най-хубавите си песни в сборен компактдиск.
